在大掌门2的后期阶段，阵容搭配的核心在于平衡输出、防御与控制能力，同时充分利用弟子之间的合璧技能与缘分羁绊。西门吹雪、萧十一郎、李寻欢是三大主流阵容的核心弟子，围绕他们构建的合璧组合能显著提升战斗力。西门吹雪与叶孤城的合璧技能具备高爆发群体伤害，燕南天与燕十三的搭配则能提供坚实的防御与补刀能力。萧十一郎阵容依赖流血特效与持续输出，而李寻欢阵容则以单体爆发和真实伤害见长。后期阵容需根据敌方特点灵活调整，例如面对高防御对手时可优先选择穿透型输出或控制类弟子。
金将阵容在后期表现尤为突出，西门吹雪、叶孤城、怜星等金将弟子通过高属性与专属技能形成压制力。西门吹雪作为群攻核心，需搭配燕十五等肉盾吸收伤害，同时利用圆月庄主的攻击增益效果提升团队输出上限。叶孤城不仅能与西门吹雪触发紫禁之巅的缘分加成，其自身大招还可提升60%攻击力，进一步强化爆发。金将阵容的养成成本较高，但成型后能应对绝大多数PVE与PVP挑战，尤其在遗迹挖掘、世界BOSS等长线玩法中优势明显。
平民玩家在后期可选择以孟星魂、燕南天为核心的性价比阵容。孟星魂凭借无视防御的特性与稳定回蓝机制，能快速击杀高血量目标，配合燕十三的增益效果可弥补群体爆发的不足。燕南天作为平民最强肉盾，拥有复活与反伤能力，搭配谢晓峰或慕容狄狄可分担输出压力。此类阵容虽缺乏顶级金将的强度，但通过合理培养与心法搭配（如金钟罩、般若波罗），仍能在中后期关卡中保持竞争力。需注意弟子突破与装备精炼的优先级，集中资源培养核心输出。
控制与辅助类弟子在后期同样不可忽视。楚留香的真气偷取与群体减怒能打乱敌方节奏，沈璧君的闪避与嘲讽效果可保护主力输出。辅助方面，邀月与怜星的合璧技能提供护盾与治疗，适合持久战阵容；快活王的反弹与云梦仙子的中毒则兼具生存与消耗能力。心法选择需与阵容定位匹配，例如输出弟子优先搭配暴击或穿透类心法，防御弟子则侧重气血与反伤属性。后期阵容的终极目标是形成闭环循环，确保输出、生存与控制链的无缝衔接。
无论是追求极致爆发的金将阵容，还是注重均衡的平民搭配，关键在于资源的合理分配与实战中的灵活应变。持续优化弟子属性与心法配置，方能应对愈发复杂的战斗环境。
